Pilier 4 - Standardisation

BaSysBiocontribuera à promouvoir une standardisation essentielle aux approches de biologie systémique et également importante pour réduire la fragmentation de la recherche européenne. L’accent sera mis sur le développement : Des expériences standardisées, les protocoles, le contexte génétique des souches et les perturbations du système; de plus, des mécanismes de control-qualité seront inclus dans les nouveaux outils développés, ainsi que dans les procédures expérimentales, afin d’assurer que les données produites par les différents partenaires soient fiables et puissent être comparées; Des normes pour la description des modèles, les représentations des réseaux et les composants destinés à être modélisés ; Des formats standardisés de données, de procédures de stockage et de récupération et de codes informatiques afin de maximiser la compatibilité entre les différents « modules cellulaires » développés par les différents partenaires et qui pourrait, à terme, être combinés. Ainsi, une utilisation constante et cohérente de langages de programmation « multi-platform and non-proprietary » adaptés à la biologie systémique sera établie. Cet effort extensif de standardisation imposera une interaction étroite et continue entre les exigences de modélisation, le développement des technologies et la planification et l’opération expérimentale favorisant ainsi une compréhension mutuelle et une collaboration étroite entre les différents partenaires autour d’un objectif commun. De ce fait, la standardisation, qui est un élément clé dans le succès des approches de la biologie systémique, apportera également une contribution importante à la réduction de la fragmentation de la science en Europe. P4 soutiendra le système d’information du projet et la standardisation de la modélisation (WP4.1) ainsi que la standardisation des expériences et des données (WP4.2).

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