L’objectif du projet BaSysBio est de comprendre la dynamique de la régulation transriptionnelle à une échelle globale dans les bactéries. Une approche de biologie systémique basée sur les cycles itératifs de prédictions de modèles mathématiques et de validation expérimentale est en cours de développement pour comprendre de façon quantitative le fonctionnement des systèmes vivants complexes. Au cours de l’année passée, une grande partie des efforts de BaSysBio s’est porter sur le développement : 1) de technologies à haut débit permettant la mesure quantitative des composants cellulaires ; 2) des modèles mathématiques pour le control transcriptionnel et métabolique à grande échelle ; 3) un système informatique pour stocker, analyser et visualiser les résultats ; et 4) d’une standardisation rigoureuse des protocoles expérimentaux.

Dans ce premier numéro de la Newsletter BaSysBio, six des principales étapes du projet sont brièvement présentées. Des descriptions plus détaillées et illustrées sont également disponibles en format pdf.

Les prochains numéros de la Newsletter BaSysBio rendront compte d’autres accomplissements scientifiques et technologiques et présenteront des informations sur les différents aspects de la vie de projet.

Pour visionner cette newsletter, vous pouvez télécharger les fichiers pdf correspondants :

• Introduction to the Newsletter
• The glucose to malate shift: Intracellular metabolite concentrations, by Uwe Sauer - ETH, Switzerland
• Bacillus subtilis Tiling arrays, by Hanne Jarmer - DTU, Denmark
• A cell array reporting on gene expression in living Bacilus subtilis, by Anthony J Wilkinson – UOY, United Kingdom
• A pressing need for standardisation in systems-level studies on living cells, by Jan Maarten van Dijl – AZG, The Nederlands
• Development of databases for large-scale experiments, by Hans Peter Fischer – Genedata, Switzerland
• An essential signal transduction pathway controlling cell wall metabolism, virulence and biofilm formation in Staphylococcus aureus, by Tarek Msadek – IP, France