Ernst-Moritz-Arndt Universität Greifswald (EMAU)
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Location : Greifswald / D |
| Leader : Michael Hecker | |
| Website : www.uni-greifswald.de |
- Description of the institution:- Description de l'institution:
L'Institut de Microbiologie à Greifswald est un laboratoire international de référence en ce qui concerne la protéomique des bactéries à Gram positif. Un modèle complet de la physiologie de la cellule bacteriennebasé sur des études protéomique et transcriptomique a été déjà établi pour la bactérie Bacillus subtilis.L'Institut est à l’origine de l'unique base de données de protéines de Bacillus subtilis "Sub-2D" (http://microbio2.biologie.uni-greifswald. de: 8880/sub2d.htm).. L’équipe maitrise parfaitement la technique de gel d’electrophorèse en 2 dimensions (« 2D protein gel electrophoresis » incluant le séquençage en N-terminal des protéines, l'identification des protéines à haut débit utilisant le MALDI-TOF et MALDI-TOF-TOF-MS, ou une analyse informatique des gels 2D (incluant la correspondance, d'imagerie «dual channel imaging », la technologie DIGE, etc.) En outre, les techniques de profilage pour l’expression comparative des protéines basées sur des approches de type « gelfree » (MDLC-ESI-MS/MS, MDLC-MALDI-MS/MS) sont établies et couramment appliquées. L'institut possède également une vaste expérience dans la caractérisation de protéines chaperonnes / protéases inductibles suite à un stress ainsi que dans la maitrise des techniques classiques de la microbiologie moléculaire.
- Key persons involved in BaSysBio:- Principales personnes impliquées dans BaSysBio:
Prof. Michael HeckerProf Michael Hecker
Directeur de l'Institut de microbiologie à l’EMAU. Les principaux thèmes de recherche de son groupe sont les suivants: (i) Analyse de la régulation globale de l'expression des gènes dans B. subtilis en utilisant l'approche protéomique, ainsi que des techniques de transcriptomiques (comprenant les micropuces à ADN), (ii) la physiologie et la biologie moléculaire des protéines spécifiques des réponses au stress et à la carence en nutriments (« stress/starvation ») dans B. subtilis ; (iii) la protéomique de B. subtilis,(iv) la réponse au stress et l'expression des gènes de virulence dans des bactéries pathogènes à Gram positif (Staphylococcus aureus).
Dr. Dörte BecherDr. Dörte Becher
Dr. Becher est chargé du groupe de spectrométrie de masse à l'Institut de Microbiologie. Elle possède 10 années d’expérience en spectrométrie de masse. Son travail est centré sur l'analyse des protéines, leur quantification et la caractérisation des modifications. Elle sera responsable de l'adaptation de l'analyse protéomique « gelfree » basée sur MDLC-MS/MS et de l'analyse des facteurs de transcription (TF) basée sur la spectrométrie de masse.
Dr. Ulrike MäderDr. Ulrike Mäder
Dr. Mäder est chargé de la transcriptomique bactérienne à Greifswald.. Elle a plusieurs années d'expérience dans le domaine des puces à ADN et des technologies de protéomiques.. Son travail est axé sur les réseaux régulateurs de l’adaptation cellulaire au stress et à la carence en nutriment dans les bactéries Gram-positives. She will be responsible for microarray analyses of Bacillus subtilis stress response in particular with regard to mRNA processing and stability. Elle sera responsable de l’analyse des micropuces ADN dans le cadre des études de la réponse au stress chez Bacillus subtilis, en particulier en ce qui concerne la maturation et la stabilité de l'ARNm.
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